La parole à Jean-Daniel Fekete

Jean-Daniel Fekete, Computer scientist (INRIA/AVIZ). Page personnelle : http://www.lri.fr/~fekete/

Réponses reçues le 1 octobre 2012

Q : Comment définissez-vous un réseau?
Un ensembre de n sommets V = {v1, v2, …, vn}
Un ensemble de m arcs E=(e1, e2, …em), e ∈
Un ensemble de o attributs de graphes Ag={(k1,a1),(k2,a2), …,(ko,ao)}, k mot clé, a valeur
Un ensemble de p attributs de sommets Av={(v1,k1,a1), (v2,k2,a2), …, (vp,kp,ap)}
Un ensemble de q attributs d’arcs Ae={(e1,k1,a1), (e2,k2,a2), …, (eq,kq,aq)}

Q : Quand avez-vous commencé à travailler sur les réseaux ?
En 1997

Q : Quelles sont vos principales influences en ce qui concerne l’analyse de réseaux ?
Jacques Bertin

Q : Quelle est votre revue scientifique favorite en ce qui concerne l’analyse de réseaux ?
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics (aspect visualisation des réseaux)

Q : Selon vous, quelles sont les principales forces de l’analyse de réseaux ?
Grande flexibilité des outils mathématiques

Q : Selon vous, quelles sont les principales faiblesses de l’analyse de réseaux ?
Domaine complexe, apprentissage difficile et validation des approches délicate parfois

Q : Y-a-t-il un article méconnu et à vos yeux essentiel en ce qui concerne l’analyse de réseaux ?
Les miens ? 😎

Leland Wilkinson (1999) Statistical methods in psychology journals: guidelines and explanations. American Psychologist, 54:594–604, 1999.
http://www.apa.org/pubs/journals/releases/amp-54-8-594.pdf

Q : Quel est votre jeu de données préféré en analyse de réseaux ?
Les publications de HAL (CNRSR ou INRIA, ce sont les mêmes)

Q : Quel est votre logiciel d’analyse de réseaux favori ?
Les miens 😎

Aucun en particulier, beaucoup sont très bien mais généralement trop compliqués.

Q : Quelle collaboration concernant l’analyse de réseaux vous a semblé la plus fructueuse ?
Les collaborations où les chercheurs SHS ont des vrais problèmes et qu’ils sont prêt à travailler vraiment (les mains à la pâte) avec des informaticiens.

Q : Pour notre prochaine interview, selon vous, qui devrions-nous contacter ?
Benno Schwikowski de l’institut Pasteur : http://www.proteomics.fr/Sysbio/People/Benno_Schwikowski
Il utilise le système Cytoscape* pour visualiser et analyser des graphes biologiques. Une approche très innovante couplant visualisation et analyse.

*Un billet est en préparation sur ce logiciel.


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